Hvorfor GAPDH brukes i Western Blot? + Eksempel

Hvorfor GAPDH brukes i Western Blot? + Eksempel
Anonim

Svar:

GAPDH brukes ofte som lastekontroll.

Forklaring:

I Western blotting bruker vi ofte GAPDH som lastekontroll. Hva dette betyr er at ved å undersøke GAPDH, kan vi kontrollere at vi har en lastet tilsvarende mengder proteiner på forskjellige baner i blottet.

Et eksempel på bruk - si at vi har en sykdom som vi tror fører til en forhøyning av et bestemt protein i cellen. Vi ville lage en prøve fra "sunne" celler og en annen prøve fra "syke" celler. Vi ville da laste ekvivalente protein mengder av begge prøver på en gel for Western blot.

Etter å ha undersøkt blottet for vårt protein av interesse, finner vi det i de syke cellene at proteinnivået faktisk er forhøyet (det er et mørkere bånd som produseres på blottet). For å bevise at denne økningen i protein skyldes en forandring av uttrykket i cellen, i stedet for en lastingsartefakt (det vil si, jo mer instansbåndet er forårsaket av en forandring i proteinuttrykk i cellene, og ikke av oss tilfeldigvis laster mer av "sykdomsprøven" enn "sunn"), ville vi også sonde blottet for GAPDH for å vise at de totale proteinnivåene er de samme i begge baner.

Ved å gjøre dette viser vi at ekvivalent protein har blitt lastet i de to banene, og at forandringen i båndintensitet vi observerer skyldes endringer i proteinuttrykk for proteinet av interesse.