Hvorfor kutter de fleste restriksjonsenzymene ved palindromisk sekvens?

Hvorfor kutter de fleste restriksjonsenzymene ved palindromisk sekvens?
Anonim

Svar:

Fordi det er mer effektivt.

Forklaring:

Enzymer som restriksjonsenzymer må gjenkjenne en meget spesifikk sekvens for å kunne utføre sin oppgave. Det binder seg til DNA bare i en bestemt konfigurasjon. Heldigvis! fordi du ikke vil ha en "pacman" som kutter DNA på tilfeldige steder.

DNA er dobbeltstrenget, så det har "to sider" som enzymet kan binde seg til. En palindromisk sekvens er den samme bakover og fremover på begge sider (se bildet nedenfor). Dette betyr at enzymet gjenkjenner sekvensen uansett hvilken side enzymet nærmer seg DNA.

En palindromisk sekvens øker også sjansen for at begge DNA-strengene blir kuttet. Det er enda mulig at to enzymer fungerer som dimer for å kutte den palindromiske sekvensen, noe som øker effektiviteten ytterligere.

Den siste årsaken har vært viktig i kampen mellom virus og bakterier. Bakterier har utviklet seg til å deaktivere bakterie-målrettede virus (bakteriofager) ved hjelp av restriksjonsenzymer som binder til disse palindromiske sekvensene. Kutting av begge strengene av DNA skader viruset mer enn å kutte en streng.